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A. मुझे DNA कहाँ cut करना है/Where do I need to cut DNA
Explanation
Simple Explanation
Cutting goal साफ होने पर enzyme choice सही होती है। Cloning planning का पहला step target site समझना है। / When the cutting goal is clear enzyme choice becomes correct. The first step in cloning planning is understanding target site.
A. recognition site और desired ends/Recognition site and desired ends
Explanation
Simple Explanation
Enzyme वही चुना जाता है जिसका recognition site useful हो और ends cloning के लिए suitable हों। / The enzyme is chosen when its recognition site is useful and ends are suitable for cloning.
A. क्योंकि वह specific recognition sequence पहचानता है/Because it recognizes a specific recognition sequence
Explanation
Simple Explanation
Restriction enzymes specific sequences पर bind करते हैं। इसलिए cut pattern predictable होता है। / Restriction enzymes bind to specific sequences. Therefore the cut pattern is predictable.
A. planned fragments और compatible ends पाने के लिए/To obtain planned fragments and compatible ends
Explanation
Simple Explanation
Recombinant DNA में insert और vector को planned way में तैयार करना होता है। Predictable cutting cloning success बढ़ाती है। / In recombinant DNA insert and vector must be prepared in a planned way. Predictable cutting increases cloning success.
Restriction enzymes DNA substrate पर काम करते हैं। वे DNA backbone के phosphodiester bonds काटते हैं। / Restriction enzymes act on DNA substrate. They cut phosphodiester bonds in the DNA backbone.
DNA की प्रत्येक शृंखला में न्यूक्लियोटाइड शर्करा-फॉस्फेट backbone द्वारा जुड़े होते हैं। दो क्रमागत न्यूक्लियोटाइडों के बीच का यह जुड़ाव फॉस्फोडाइएस्टर बंध कहलाता है। Restriction endonucleases DNA को विशिष्ट पहचान-अनुक्रमों पर इसी बंध को तोड़कर काटते हैं। पेप्टाइड बंध प्रोटीनों में पाए जाते हैं। परीक्षा टिप: DNA backbone के लिए हमेशा sugar-phosphate और phosphodiester bond को साथ याद रखें। / In each DNA strand, successive nucleotides are connected through the sugar-phosphate backbone. The linkage between two consecutive nucleotides is a phosphodiester bond. Restriction endonucleases cut DNA at specific recognition sequences by breaking these bonds. Peptide bonds occur in proteins, not in DNA. Exam tip: Associate the DNA backbone with sugar-phosphate and phosphodiester bonds.
A. क्योंकि यह nucleic acid chain के अंदर cut करता है/Because it cuts inside a nucleic acid chain
Explanation
Simple Explanation
Endonuclease nucleic acid के internal phosphodiester bonds काटता है। Restriction enzymes इसी group में हैं। / An endonuclease cuts internal phosphodiester bonds in nucleic acids. Restriction enzymes are in this group.
A. Exonuclease ends से हटाता है और restriction endonuclease अंदर specific site काटता है/Exonuclease removes from ends and restriction endonuclease cuts internal specific site
Explanation
Simple Explanation
Restriction endonuclease specific internal sites काटता है। Exonuclease nucleotides ends से remove करता है। / Restriction endonuclease cuts specific internal sites. Exonuclease removes nucleotides from ends.
A. विदेशी DNA को काटकर उससे रक्षा करना/Defense against foreign DNA by cutting it
Explanation
Simple Explanation
Restriction enzymes बैक्टीरिया की रक्षा-प्रणाली का भाग हैं। ये बैक्टीरियोफेज जैसे बाहरी DNA को पहचानकर विशिष्ट अनुक्रमों पर काट देते हैं, जिससे उसका संक्रमण रुक सकता है। प्रोटीन folding का कार्य chaperone proteins करते हैं, restriction enzymes नहीं। परीक्षा टिप: restriction enzyme का मुख्य कार्य DNA को specific sites पर काटना याद रखें। / Restriction enzymes are part of the bacterial defence system. They recognise and cut incoming foreign DNA, such as bacteriophage DNA, at specific sequences and can thereby prevent infection. Protein folding is performed by chaperone proteins, not restriction enzymes. Exam tip: remember that restriction enzymes cut DNA at specific recognition sites.
Host DNA methylation own recognition sites को protect कर सकती है। Foreign unmethylated DNA cut हो सकता है। / Host DNA methylation can protect its own recognition sites. Foreign unmethylated DNA can be cut.
Modification part host DNA को methylate करके protection देता है। Restriction part foreign DNA काटता है। / The modification part protects host DNA by methylation. The restriction part cuts foreign DNA.
A. नाम source organism से derived होता है/The name is derived from source organism
Explanation
Simple Explanation
Restriction enzyme names organism genus species strain और discovery order से जुड़े हो सकते हैं। यह exam fact है। / Restriction enzyme names can relate to organism genus species strain and discovery order. This is an exam fact.
Roman numeral discovery order बताता है। EcoRI में I first identified enzyme को दर्शाता है। / The Roman numeral indicates discovery order. In EcoRI I indicates the first identified enzyme.
A. प्रतिबंध एन्डोन्यूक्लिएज़/Restriction endonuclease
Explanation
Simple Explanation
EcoRI एक प्रतिबंध एन्डोन्यूक्लिएज़ है। यह DNA के विशिष्ट पहचान-अनुक्रम, जैसे GAATTC, को पहचानकर दोनों DNA strands को काटता है और सामान्यतः sticky ends बनाता है। DNA ligase इसके विपरीत DNA के कटे हुए टुकड़ों को जोड़ता है, काटता नहीं है। परीक्षा टिप: EcoRI, HindII और BamHI जैसे नाम दिखें तो उन्हें restriction enzymes से जोड़ें। / EcoRI is a restriction endonuclease. It recognises a specific DNA recognition sequence, such as GAATTC, and cuts both DNA strands, typically producing sticky ends. DNA ligase is a close distractor because it acts on DNA too, but it joins cut DNA fragments rather than cutting them. Exam tip: Names such as EcoRI, HindII and BamHI indicate restriction enzymes.
A. दोनों strands opposite direction में समान पढ़े जाते हैं/Both strands read the same in opposite directions
Explanation
Simple Explanation
कई restriction enzymes palindromic DNA sequences पहचानते हैं। यह recognition specificity की key feature है। / Many restriction enzymes recognize palindromic DNA sequences. This is a key feature of recognition specificity.
A. enzyme उस DNA को उस site पर नहीं काटेगा/The enzyme will not cut that DNA at that site
Explanation
Simple Explanation
Restriction enzyme को recognition site चाहिए। Site absent होने पर expected cut नहीं मिलेगा। / A restriction enzyme needs a recognition site. If the site is absent expected cut will not occur.
Linear DNA एक खुला, सीधा DNA अणु होता है। इसमें एक स्थान पर कट लगने से DNA दो अलग-अलग टुकड़ों में विभाजित हो जाता है, इसलिए दो fragments बनते हैं। एक fragment तब रहता है जब कोई कट न लगे; इसके विपरीत, circular DNA में एक cut उसे सामान्यतः एक linear fragment में बदलता है। परीक्षा टिप: linear DNA के लिए fragments की संख्या = cut sites + 1 होती है। / Linear DNA has two free ends. A cut at one site divides it into two separate pieces, so two fragments are formed. One fragment would remain if there were no cut; in contrast, one cut in circular DNA usually produces one linear fragment. Exam tip: for linear DNA, number of fragments = number of cut sites + 1.
Linear DNA में number of fragments usually cut sites plus one होता है। तीन cuts से चार fragments बनते हैं। / In linear DNA number of fragments is usually cut sites plus one. Three cuts make four fragments.
वृत्ताकार DNA में केवल एक कट लगने पर उसकी बंद वृत्ताकार संरचना खुल जाती है और एक रेखीय DNA अणु बनता है। दो वृत्ताकार अणु तभी बन सकते हैं जब DNA प्रतिकृत हो और अलग-अलग अणु बनें; केवल एक कट से ऐसा नहीं होता। परीक्षा टिप: वृत्ताकार DNA में कटों की संख्या बढ़ने पर सामान्यतः बनने वाले रेखीय खंडों की संख्या भी उतनी होती है। / A single cut in circular DNA opens its closed loop and produces one linear DNA molecule. Two circular DNA molecules cannot be produced by merely making one cut; that would require replication and separation of DNA molecules. Exam tip: for circular DNA, the number of cuts generally equals the number of linear fragments formed.
वृत्ताकार प्लास्मिड DNA में दो अलग-अलग स्थानों पर कट लगने से DNA दो खंडों में विभाजित हो जाता है। इसलिए सही उत्तर दो DNA fragments है। केवल एक कट लगने पर सामान्यतः एक linear DNA fragment बनता है, इसलिए विकल्प B निकटतम लेकिन गलत है। परीक्षा टिप: वृत्ताकार DNA में बने fragments की संख्या सामान्यतः कट sites की संख्या के बराबर होती है। / When a circular plasmid DNA is cut at two different sites, it is divided into two DNA fragments. Therefore, two DNA fragments is correct. A single cut would generally produce one linear DNA fragment, making option B the closest but incorrect distractor. Exam tip: for circular DNA, the number of fragments generally equals the number of cut sites.
A. cut pattern verify करने के लिए/To verify cut pattern
Explanation
Simple Explanation
Fragment count expected map से match होना चाहिए। इससे digestion और construct verification होती है। / Fragment count should match the expected map. This verifies digestion and construct.
DNA fragments gel में size के अनुसार migrate करते हैं। छोटे fragments सामान्यतः तेज चलते हैं। / DNA fragments migrate according to size in gel. Smaller fragments generally move faster.
DNA phosphate backbone के कारण negatively charged होता है। इसलिए वह positive electrode की ओर जाता है। / DNA is negatively charged due to phosphate backbone. Therefore it moves toward positive electrode.
A. fragment size estimate करना/Estimating fragment size
Explanation
Simple Explanation
DNA ladder known size bands देता है। इससे sample fragments का approximate size निकाला जाता है। / DNA ladder gives known size bands. It helps estimate approximate size of sample fragments.
A. incomplete digestion या wrong clone/Incomplete digestion or wrong clone
Explanation
Simple Explanation
Expected band absent होना digestion failure wrong clone या low DNA दिखा सकता है। Controls check करें। / Absence of expected band can show digestion failure wrong clone or low DNA. Check controls.
A. कम मात्रा में DNA लोड करना/Loading too little DNA
Explanation
Simple Explanation
जेल इलेक्ट्रोफोरेसिस में बहुत कम DNA लोड करने पर dye से बंधने के लिए DNA कम होता है, इसलिए बैंड बहुत हल्के दिखाई दे सकते हैं। जेल को अधिक समय तक चलाने से बैंड फैल सकते हैं या जेल से बाहर जा सकते हैं, पर यह faint bands का सबसे सामान्य कारण नहीं है। परीक्षा टिप: हल्के बैंड दिखें तो पहले DNA की concentration और loaded volume जाँचें। / In gel electrophoresis, loading too little DNA leaves less DNA available to bind the stain, so the bands may appear very faint. Running a gel too long can cause bands to diffuse or run out of the gel, but it is not the most common cause of faint bands. Exam tip: For faint bands, first check the DNA concentration and the volume loaded.
A. partial digestion या star activity/Partial digestion or star activity
Explanation
Simple Explanation
Extra bands incomplete cutting या non-specific cutting का संकेत दे सकते हैं। Reaction conditions check करें। / Extra bands can indicate incomplete cutting or non-specific cutting. Check reaction conditions.
अवक्रमित DNA अलग-अलग लंबाई के बहुत से अनियमित खंडों का मिश्रण होता है। जेल इलेक्ट्रोफोरेसिस में ये खंड स्पष्ट bands के बजाय फैली हुई smear के रूप में दिख सकते हैं। पूर्णतः अक्षुण्ण DNA सामान्यतः अपने आकार के अनुसार स्पष्ट band देता है; इसलिए वह smear का कारण नहीं है। परीक्षा टिप: smear दिखे तो DNA की गुणवत्ता, nuclease contamination और sample handling की जाँच करें। / Degraded DNA contains a mixture of many irregular fragment sizes. During gel electrophoresis, these fragments may appear as a diffuse smear rather than sharp bands. Perfectly intact DNA would usually give a clear band according to its size, so it is not the likely cause. Exam tip: when a smear is observed, check DNA quality, nuclease contamination, and sample handling.
A. good DNA quality और proper digestion/Good DNA quality and proper digestion
Explanation
Simple Explanation
Sharp expected bands clean DNA और correct digestion का संकेत दे सकते हैं। फिर भी map से compare करना जरूरी है। / Sharp expected bands can indicate clean DNA and correct digestion. Still comparison with map is necessary.
A. phenol ethanol या salt carryover/Phenol ethanol or salt carryover
Explanation
Simple Explanation
Phenol ethanol और salts enzyme activity inhibit कर सकते हैं। Digestion से पहले cleanup useful हो सकता है। / Phenol ethanol and salts can inhibit enzyme activity. Cleanup can be useful before digestion.
A. enzyme और DNA amount सही रखने के लिए/To keep enzyme and DNA amount correct
Explanation
Simple Explanation
DNA amount जानकर enzyme units और reaction setup सही किया जाता है। इससे digestion reliable होती है। / Knowing DNA amount helps set enzyme units and reaction correctly. This makes digestion reliable.
A. enzyme activity amount समझने के लिए/To understand enzyme activity amount
Explanation
Simple Explanation
Enzyme units बताते हैं कि defined conditions में enzyme कितना DNA काट सकता है। Reaction setup में यह useful है। / Enzyme units show how much DNA the enzyme can cut under defined conditions. This is useful in reaction setup.
यदि restriction enzyme की मात्रा बहुत कम हो, तो वह DNA के सभी पहचान स्थलों को नहीं काट पाता। इसलिए कुछ DNA अणु या स्थल बिना कटे रह जाते हैं और आंशिक पाचन होता है। स्टार गतिविधि सामान्यतः अनुचित buffer, अधिक enzyme या लंबे incubation जैसी स्थितियों से जुड़ी होती है, कम enzyme से नहीं। परीक्षा टिप: कम enzyme या कम समय को incomplete/partial digestion से जोड़ें। / If the amount of restriction enzyme is too low, it may not cut all recognition sites in the DNA. Some sites therefore remain uncut, resulting in partial digestion. Star activity is generally associated with conditions such as an unsuitable buffer, excess enzyme, or prolonged incubation, not too little enzyme. Exam tip: Link insufficient enzyme or insufficient incubation time with incomplete/partial digestion.
A. स्टार गतिविधि, अर्थात गैर-विशिष्ट स्थलों पर कटना/Star activity, i.e. cleavage at non-specific sites
Explanation
Simple Explanation
Restriction enzyme की बहुत अधिक मात्रा डालने पर, विशेषकर जब अंतिम glycerol concentration बढ़ जाए, enzyme की specificity कम हो सकती है। इससे star activity होती है और DNA अपेक्षित recognition site के अलावा मिलते-जुलते गैर-विशिष्ट स्थलों पर भी कट सकता है। DNA का न कटना आमतौर पर enzyme की कमी, गलत buffer या अनुचित incubation से जुड़ा होता है। परीक्षा टिप: excess restriction enzyme का मुख्य जोखिम याद रखें—non-specific cleavage (star activity)। / Using too much restriction enzyme, especially when it raises the final glycerol concentration, can reduce enzyme specificity. This causes star activity, in which DNA may be cut at sites similar to, but different from, the intended recognition sequence. Complete failure of cutting is more commonly associated with too little enzyme, an incorrect buffer, or unsuitable incubation conditions. Exam tip: link excess restriction enzyme with non-specific cleavage or star activity.
A. enzyme activity best रखने के लिए/To keep enzyme activity best
Explanation
Simple Explanation
Enzymes specific temperature range में best काम करते हैं। Wrong temperature digestion fail कर सकता है। / Enzymes work best in a specific temperature range. Wrong temperature can make digestion fail.
A. प्रतिबंध एंजाइम की संरचना और गतिविधि के लिए अनुकूल pH बनाए रखने के लिए/To maintain an optimal pH for the restriction enzyme's structure and activity
Explanation
Simple Explanation
प्रतिबंध एंजाइम प्रोटीन होते हैं और उनकी सक्रियता pH पर निर्भर करती है। उचित buffer एंजाइम की संरचना तथा सक्रिय स्थल के लिए अनुकूल pH बनाए रखता है, जिससे DNA सही स्थानों पर कटता है। Agarose gel को घोलना gel electrophoresis की तैयारी से जुड़ा कार्य है, digestion buffer का नहीं। परीक्षा टिप: restriction digestion में buffer का मुख्य कार्य उचित pH और आवश्यक आयन उपलब्ध कराना है। / Restriction enzymes are proteins, and their activity depends on pH. A suitable buffer maintains the optimal pH needed for the enzyme’s structure and active site, allowing DNA to be cut at the correct recognition sites. Dissolving agarose gel is part of preparing for gel electrophoresis, not a function of the digestion buffer. Exam tip: a restriction-digestion buffer primarily provides the correct pH and essential ions.
A. unwanted DNA degradation रोकने के लिए/To prevent unwanted DNA degradation
Explanation
Simple Explanation
Nuclease contamination DNA को unwanted fragments में तोड़ सकती है। Nuclease-free water sample बचाता है। / Nuclease contamination can break DNA into unwanted fragments. Nuclease-free water protects the sample.
A. contamination और sample mix-up कम करने के लिए/To reduce contamination and sample mix-up
Explanation
Simple Explanation
Fresh tips nucleases और cross-contamination से बचाते हैं। यह clean reaction के लिए जरूरी है। / Fresh tips avoid nucleases and cross-contamination. This is needed for a clean reaction.
A. clear labelling और lane map/Clear labelling and lane map
Explanation
Simple Explanation
Clear labels reactions को identify करते हैं और lane map gel interpretation बचाता है। यह record keeping का part है। / Clear labels identify reactions and lane map protects gel interpretation. This is part of record keeping.
A. enzyme buffer time temperature expected bands observed bands
Explanation
Simple Explanation
Complete documentation repeat experiment और troubleshooting में मदद करती है। Expected और observed bands compare करें। / Complete documentation helps repeat experiment and troubleshooting. Compare expected and observed bands.
A. final clone sequence confirm करने के लिए/To confirm final clone sequence
Explanation
Simple Explanation
Restriction digest size pattern देता है पर exact base sequence नहीं बताता। Sequencing final confirmation देती है। / Restriction digest gives size pattern but not exact base sequence. Sequencing gives final confirmation.
A. Restriction digest संगत DNA सिरे बनाता है, जिन्हें DNA ligase जोड़ता है/Restriction digest creates compatible DNA ends, which DNA ligase joins
Explanation
Simple Explanation
Restriction endonuclease DNA को विशिष्ट पहचान अनुक्रमों पर काटता है और sticky या blunt सिरे बनाता है। जब vector और इच्छित DNA खंड के सिरे संगत होते हैं, तब DNA ligase उनके बीच phosphodiester बंध बनाकर उन्हें जोड़ देता है। विकल्प B में एंजाइमों के कार्य उलटे बताए गए हैं। परीक्षा टिप: याद रखें—restriction enzyme काटता है, जबकि ligase जोड़ता है। / A restriction endonuclease cuts DNA at specific recognition sequences and produces sticky or blunt ends. When the vector and desired DNA fragment have compatible ends, DNA ligase forms phosphodiester bonds to join them. Option B reverses the functions of the enzymes. Exam tip: remember that restriction enzymes cut, whereas ligase joins.
A. ligation या recombinant DNA formation/Ligation or recombinant DNA formation
Explanation
Simple Explanation
DNA fragments को ligase से जोड़कर recombinant DNA बनाया जाता है। फिर इसे host में introduce किया जाता है। / DNA fragments are joined by ligase to make recombinant DNA. Then it is introduced into a host.
A. compatible ends पाने के लिए/To obtain compatible ends
Explanation
Simple Explanation
Vector और insert compatible ends रखते हैं तो ligation आसान होती है। यह recombinant DNA formation का आधार है। / When vector and insert have compatible ends ligation is easier. This is the basis of recombinant DNA formation.
A. origin और marker जैसे जरूरी elements बचाने के लिए/To keep essential elements like origin and marker
Explanation
Simple Explanation
Vector backbone में replication origin और selectable marker होते हैं। गलत cutting vector function खराब कर सकती है। / Vector backbone contains replication origin and selectable marker. Wrong cutting can damage vector function.
A. desired gene function बचाने के लिए/To preserve desired gene function
Explanation
Simple Explanation
अगर insert unwanted cut हो जाए तो desired gene function खो सकता है। Internal sites check करें। / If the insert is cut unwantedly desired gene function can be lost. Check internal sites.
A. gel पर expected DNA band pattern/Expected DNA band pattern on gel
Explanation
Simple Explanation
Expected band pattern digestion success का visual evidence देता है। Compare with ladder और controls। / Expected band pattern gives visual evidence of digestion success. Compare with ladder and controls.
A. enzyme और recognition site को match न करना/Not matching enzyme and recognition site
Explanation
Simple Explanation
Restriction enzyme तभी cut करेगा जब उसका recognition site मौजूद हो। Enzyme-site matching हमेशा check करें। / A restriction enzyme cuts only if its recognition site is present. Always check enzyme-site matching.
A. recognition site cutting ends gel verification ligation
Explanation
Simple Explanation
Cutting of DNA में enzyme site पहचानता है और fragments बनाता है। Gel verification के बाद ligation होती है। / In Cutting of DNA the enzyme recognizes a site and makes fragments. Ligation follows gel verification.
A. restriction enzymes DNA को specific sites पर काटकर cloning के लिए compatible fragments बनाते हैं/Restriction enzymes cut DNA at specific sites to make compatible fragments for cloning
Explanation
Simple Explanation
Restriction digestion recombinant DNA technology की central step है। सही enzyme condition controls और gel analysis याद रखें। / Restriction digestion is a central step of recombinant DNA technology. Remember correct enzyme condition controls and gel analysis.
