Why are extra bases kept in a primer containing restriction site?Restriction site वाले primer में extra bases क्यों रखे जाते हैं?
Answer and explanationउत्तर और व्याख्या
Correct answer:सही उत्तर: To help enzyme cut efficiently near DNA endenzyme को DNA end के पास efficiently cut करने में मदद के लिए
The direct answer is A: extra bases help a restriction enzyme cut efficiently near the end of DNA. A restriction site added to a primer is often placed at the 5′ end. If the recognition sequence lies exactly at the physical end of a PCR product, some enzymes cannot bind or cut efficiently because they need a short stretch of DNA outside the recognition site. Extra, non-target bases provide this needed flanking region. Thus, after amplification and digestion, the desired sticky or blunt end can be produced more reliably. Option A is correct. B is wrong because primers do not become proteins; proteins are made during translation. C is wrong because extra bases do not stop a gel. D is wrong because they are not added to methylate DNA; methylation is a separate chemical modification. The exact number of extra bases depends on the enzyme and protocol, so laboratory instructions must be followed. Exam cue: restriction site plus a short 5′ flank improves digestion at a DNA end.सीधा उत्तर A है: extra bases DNA के end के पास restriction enzyme को प्रभावी ढंग से काटने में सहायता करते हैं। Primer के 5′ end पर restriction site जोड़ी जाती है। यदि recognition sequence PCR product के बिल्कुल किनारे पर हो, तो कुछ enzymes ठीक से bind या cut नहीं कर पाते, क्योंकि उन्हें recognition site के बाहर DNA का थोड़ा अतिरिक्त भाग चाहिए। Extra non-target bases यह flanking region देते हैं। इसके बाद digestion अधिक भरोसेमंद ढंग से desired sticky या blunt end बना सकता है। इसलिए A सही है। B गलत है, क्योंकि primer protein नहीं बनता; protein translation से बनता है। C गलत है, क्योंकि extra bases gel को नहीं रोकते। D गलत है, क्योंकि इनका उद्देश्य DNA methylation नहीं है; methylation अलग chemical modification है। Extra bases की सही संख्या enzyme और protocol पर निर्भर करती है। याद रखें: restriction site से पहले छोटा 5′ extra sequence cutting efficiency बढ़ाता है।
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